复旦科技园科技创新基地成立于2009年，地处上海市虹口区松花江路2539号，孵化面积2万平方米，是复旦大学国家大学科技园科创孵化生态链条的重要环节和创新创业服务体系的重要组成部分。运营主体上海复旦科技园科技创新基地有限公司是上海复旦科技园股份有限公司的全资子公司。在虹口区政府的大力支持下，基地由上海复旦科技园股份有限公司与上海材料研究所联合开发，以“促进科技成果转化，培育科技企业和企业家精神”为宗旨，依托复旦大学一流的学科建设和充沛的人才资源，聚焦智能光学、生态环境、生物医药、文化教育等产业，整合人才、知识、技术、资本、机构、载体等创新要素，综合提供物理空间、共享设施和专业化服务，致力于打造高水准、集群化、国际化的科技企业孵化器、创新创业人才培养阵地、大众创新创业支撑平台，不断推动高校科技成果转化为现实生产力。

基地紧邻复旦大学、同济大学、上海财经大学科技园和杨浦创业中心，位于曲阳大柏树商圈、五角场副中心商圈、四平路商圈三大商圈交融之处，配套设施便利，富有浓厚的创新创业氛围。

科创基地基于现代化孵化器运行方式建立了较为完善的组织架构，目前共有专职人员5人，兼职人员3人，本科及以上学历人员占比100%，参加孵化器从业人员培训并取得证书人员占比100%。截至2023年底，创业企业和团队数总计41家，带动就业650余人，帮助在孵企业申请到贴息贷款及获得各类融投资超过1800万元。